Kostel sv. Jakuba Většího patří mezi nejvýznamnější památky Prachatic. Sv. Jakub Větší, jemuž je kostel zasvěcen, je patronem kupců, obchodníků, poutníků, nosičů nákladů a sirotků a byl vybrán zejména proto, že Prachaticemi vedla tzv. Zlatá stezka a z Pasova sem zavítalo mnoho obchodníků. Kostel byl založen již ve 14. století, ale husitské války a následný velký požár se podepsaly jak na vzhledu kostela, tak i na vzhledu samotného města. Proto byl kostel v 16. století přestavěn – rozšíření na trojlodí, dostavění jižní věže, nová klenba a krov kostela. V 19. století byl bohužel v Prachaticích další požár, po kterém kostel dostal svou nynější podobu – tedy jeho věž byla vystavěna do podoby minaretu. Interiér kostela je neméně zajímavý! Cenné jsou zejména původní pozdně gotické lavice, sanktuář se sochou sv. Václava a reliéfy Zvěstování, Narození Páně a Tří králů z počátku 16. století. Dále hlavní oltář v barokním slohu od řezbáře Jana Webra či kazatelna z 18. století. Na vnější části presbytáře se nachází nástěnné malby Ukřižování Krista z roku 1516.